Perikanan tangkap terdapat di Kecamatan Watubangga, Tanggetda, Pomlaa, Wundulako, Kolaka. Latambaga, Wolo, Samaturu dan Toari. Potensinya mencapai 37.500 ton. Saat ini produksi baru mencapai 19.695,9 ton/tahun.
Budidaya perikanan terdapat di seluruh kecamatan di Kabupaten Kolaka. Meliputi budidaya perikanan laut, karamba, jaring apung, tambak, sawah, dan kolam. Potensi wilayah untuk budidaya ini mencapai 8.501,5 hektar dan baru terolah 4.684,5 hektar.
Pengolahan ikan terdapat di Kecamatan Latambaga.
Selain ikan, rumput laut juga menjadi unggulan Kolaka. Potensinya sekitar 7.000 hektar dan baru dikelola 1.194,25 hektar.